- Биохимические утилиты
Биохимические утилиты
Калькулятор Хи-квадрат, критерия Фишера, относительного риска. Калькулятор одновременно рассчитывает chi-square, Fisher criteria и odds ratio для матрицы 2х2.
Критерий Фишера рассчитывается двусторонний.
Расчет количества нуклеотидов для одноцепочечной ДНК. Сильно облегчает жизнь тем, кто часто ставит ПЦР.
Калькулятор для расчета хи-квадрат. Можно сказать, что это основной статистический расчет в биологической статистике.
Разработка авторов "Кировской Молекулярной Биологии".
Зная длину планируемых рестрицированных фрагментов можно "погонять" форез виртуально,
не расходуя время, деньги и реактивы.
И нервы целее будут - если какие-то полосы сливаются, то это будет видно сразу.
Важно! Актуальная версия скрипта имеет некоторые ограничения:
- Результат верен только для ДНК
- Расчет ведется без учета плотности носителя
- Расчет ведется в относительных единицах (Rf)
Преобразование последовательности ДНК. Комплементарная цепь, реверс, разбивка по блокам для печати.
Вспомогательная утилита подбора пар праймеров для реакции ПЦР.
Вспомогательная утилита для преобразования файла формата *.seq Fasta в формат для программы Treecon.
Вспомогательная утилита для поиска сайтов рестрикции в нуклеотидной последовательности.
Оцифровка дорожек электофореза. Строится график для выделенной области и возвращается таблица с данными для сохранения в csv и дальнейшей обработки.
Подсчет процента гомологии после множественного выравнивания.
Подсчет температуры плавления как по классической схеме, так и с учетом термодинамики и концентрации солей и магния.