Программа просмотра хроматограмм для простых проектов секвенирования ДНК, которые не требуют сборки нескольких последовательностей.
Chromas имеет следующие особенности:
Открывает файлы хроматограммы .ab1 из секвенаторов ДНК Applied Biosystems.
Открывает файлы хроматограмм в формате SCF и ZTR, созданные другими секвенаторами или извлеченные из баз данных.
Сохраняет в формате *.scf или Applied Biosystems *.ab1.
Печатает хроматограмму с увеличением масштаба и подгонки размера под размер страницы.
Автоматическое удаление некачественной последовательности (при наличии данных о качестве) или векторных последовательностей.
Экспортирует данные последовательности в формате обычного текста, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank или GCG или в формате с базовой нумерацией для представления.
Копирует последовательность в буфер обмена в виде простого текста, в формате FASTA или FASTQ для вставки в другие приложения.
Показывает обратную и комплементарную последовательность хроматограммы.
Поиск подпоследовательностей путем точного соответствия или оптимального выравнивания.
Показывает трансляцию последовательности в трех рамках считывания вместе с последовательностью.
Позволяет скопировать изображение части хроматограммы для вставки в документы или презентации.
Пакетная обработка, включая преобразование формата, экспорт последовательности с векторным удалением, пакетная печать и пакетный экспорт необработанных данных.
Позволяет отредактировать файлы .ab1, используя компонент PeakTrace RP от Nucleics Pty Ltd, чтобы улучшить читаемость пиков и извлечь больше высококачественных оснований, за счет оптимизации базовой линии.
Программа бесплатна, работает в Windows, Linux (под Wine).
Дистрофин - Крупный мышечный белок (молекулярная масса дистрофина человека – 427 кД), связанный с внешней мембраной многоядерных мышечных волокон и вовлеченный в патогенез широко распространенных мышечных дистрофий (Дюшенна и Беккера). Ген дистрофина сцеплен с Х-хромосомой и является одним из самых больших известных генов человека (длина около 2,5 млн. пар нуклеотидов, состоит из 65 экзонов).
Нуклеиновые кислоты - Природные полинуклеотиды, в которых нуклеотидные остатки соединены между собой в определенной последовательности фосфодиэфирными связями.